Учёные открыли 21 новый ген, связанный с астмой, упущенный ранее

DANDELION объединил анализ генетических связей с проверкой кандидатов в CRISPR-экспериментах и на мышах

Исследователи из Колумбийского университета и Чикагского университета разработали вычислительный подход DANDELION для выявления генов, которые играют непосредственную роль в развитии сложных заболеваний. В исследовании, посвящённом астме, опубликованном в журнале Cell, этот метод выделил 21 ген, связанный с заболеванием, большинство из которых не были обнаружены традиционными методами.

Геномные исследования ассоциаций выявляют варианты ДНК, статистически связанные с риском заболевания, но такая связь не указывает, какой именно ген вызывает данные изменения. DANDELION анализирует регуляторные связи между генами и стремится определить центральные узлы, через которые вариант ДНК может оказывать влияние на другие гены.

Кандидаты были протестированы с применением CRISPR-скрининга (массовой проверки влияния генов на клеточные характеристики) и экспериментов на мышах. Эти испытания подтвердили клеточные и физиологические характеристики, связанные с астмой. Два гена оказались связанными с общим путём, который включает обмен жирными кислотами и белковое пальмитирование (присоединение жирной кислоты к белку). Ранее этот путь не изучался в контексте астмы.

«Современные генетические методы часто выявляют сотни изменений ДНК, связанных с риском заболеваний, но бывает сложно установить, какие гены действительно вызывают болезнь», — отметила Чжунхуа Лю (Zhonghua Liu), доцент Колумбийского университета. Авторы рассматривают обнаруженный путь как потенциальную основу для будущего поиска терапевтических мишеней, однако клиническое лечение, основанное на этом исследовании, пока отсутствует.